Um dos primeiros habitantes do lugar chamava-se Ponciano. Ponciano era caçador, e afim de  facilitar sua atividade de caça construiu um girau, pequena armação de madeira onde os animais abatidos eram colocados. Daí, então o nome  Girau do Ponciano.

No local onde hoje é a cidade de Girau do Ponciano chegaram, em data desconhecida, aqueles que são considerados os responsáveis pela fundação do habitantes. Eram dois homens e uma mulher, cuja procedência não se sabe. Só se sabe apenas o nome de um deles, cuja cidade leva seu nome, Ponciano. Os pioneiros instalaram uma propriedade naquele lugar, dedicando-se à agricultura. Algum tempo depois, um dos homens e a mulher saíram da propriedade, porém Ponciano permaneceu no local e construiu um ‘girau’ que utilizava para colocar a caça.

Após alguns anos, uma senhora chamada Cidade Rodrigues e seus filhos Manoel e Antônio estabeleceram uma nova propriedade na região, levando maior movimentação àquele lugar. O rápido progresso da localidade foi consequência da fertilidade das terras, bem como da chegada de novos proprietários.

A primitiva denominação do povoado era Belo Horizonte. Porém, no início do século XX, por volta de 1912, seu nome foi modificada para Vila Ponciano e já apresentava o aspecto de um povoado rico. Esse desenvolvimento cada vez maior, fez com que alguns líderes iniciassem um movimento em prol da emancipação política da vila. Dentre eles, destacaram-se Filadelfo Firmino de Oliveira, Amaro José Bezerra, Júlio Bispo dos Santos, Pedro Lima de Oliveira, Manoel João Neto, Vicente Ramos da Silva, Luiz de Albuquerque Lima, Luiz Bispo dos Santos e Manoel Firmino de Oliveira. Apesar de Traipu não gostar muito da ideia de emancipação, pois com isso iria perder além de território com terras prósperas, um distrito que lhe trazia bons rendimentos, a vila acabou sendo elevada à categoria de município independente com o nome de Girau do Ponciano, por meio da Lei nº 2.101, de 15 de julho de 1958.

Desmembrado de Traipu, o novo município foi estabelecido oficialmente em 1º de janeiro de 1959. Após a emancipação, assumiram o governo municipal, em caráter provisório, dois prefeitos nomeados, respectivamente, José Pinheiro (1958-1959) e Manoel João neto (1959-1962). O primeiro prefeito eleito pela população foi Vicente Ramos da Silva, que governou de 1962 a 1966.

Com relação à religiosidade, a padroeira da cidade é Nossa Senhora Imaculada da Conceição, cuja festa é solenemente celebrada dia 8 de dezembro. Sendo também, realizada festas durante o ano nos sítios e povoados em celebração aos seus Santos. A primeira capela do antigo povoado foi erigida em 1930 e remodelada em 1976. A paróquia foi criada em 11 de janeiro de 1987 por Dom Constantino Leürs, então bispo de Penedo. Atualmente, o pároco é Ronaldo Vitalino da Silva. A freguesia integra o Vicariato de Traipu e está sob a jurisdição canônica da Diocese sanfranciscana, cujo Bispo é Dom Valério Breda (SDB).